哀牢山、无量山国家级自然保护区被世界自然基金会确认为具有全球保护意义的A级自然保护区,是地球同纬度带上生物资源最为丰富的自然综合体,在不到万分之一的国土面积上保留了占全国三分之一的物种,堪称“天然物种基因库”。
国家一类重点保护动物黑冠长臂猿,在全球仅无量山尚存50群400只左右,
为世界仅有。此外,尚有一类保护动物金丝猴、熊猴、蜂猴、墨鹳、黑颈长尾雉、绿孔雀、豚尾猴、灰叶猴、云豹、金钱豹、虎等11种;二类保护动物有穿山甲、马鹿、黑熊、猕猴等16种;有鸟类300多种,列为国家保护的珍禽有白腹锦鸡、红腹角雉、白鹇、原鸡、冠斑犀鸟、绯胸鹦鹉、凤头鹰、猛隼等30多种。
无量山有画眉50种,占全国百分之三十八,全省百分之四十六,有“画眉之乡”的美誉。有高等植物近2000种,其中,国家一级保护植物有云南红豆杉、蓖齿苏铁、野银杏、长蕊木兰、中华桫椤5种,有保持原始状态的云南铁杉林6210亩,还有黄连、何首乌、香椽、吴萸、荜拨等上千种药材。
至2007年,境内己探明储量较多的矿产资源有褐煤、石棉、重晶石、铅、锌、锑、铜、铁、铬、绿泥石、石膏、沙金、水晶石、盐矿、滑石、黄铁矿。褐煤储量729万吨,铜储量2万金属吨,石灰石蕴藏量达5000万立方米。